Fakturę wysłaną do KSeF przez pomyłkę trzeba skorygować do zera

Dyrektor KIS w indywidualnej interpretacji wyjaśnił konsekwencje omyłkowego wprowadzenia do KSeF faktur, które wcześniej zostały poprawnie wystawione poza tym systemem.

Spółka będąca czynnym podatnikiem VAT w lipcu 2026 r. przez pomyłkę przesłała do Krajowego Systemu e-Faktur (KSeF) paczkę danych zawierającą faktury pierwotnie wystawione poza KSeF w lutym i marcu 2026 r. i wówczas rozliczone. System przetworzył te dokumenty i nadał im numery identyfikacyjne KSeF. W wyniku tej pomyłki w obrocie prawnym pojawiły się faktury ustrukturyzowane odzwierciedlające zdarzenia gospodarcze, które zostały już wcześniej udokumentowane, rozliczone i zamknięte pod kątem podatkowym.

Spółka wystąpiła o indywidualną interpretację podatkową, aby dowiedzieć się o prawidłowy sposób postępowania w tej sytuacji. We wniosku o interpretację oraz w jego uzupełnieniu spółka wyjaśniła, że:

• faktury przesłane do systemu KSeF w lipcu 2026 r. zawierały numery, daty sprzedaży, pozycje asortymentowe oraz kwoty (zarówno netto, podatek VAT jaki i brutto) w 100% tożsame i identyczne z danymi znajdującymi się na fakturach tradycyjnych wystawionych poza KSeF w lutym i marcu 2026 r.,
• faktury wystawione poza KSeF za luty oraz marzec 2026 r. bezpośrednio zostały wysłanie do kontrahentów drogą elektroniczną na wskazane w zamówieniach adresy e-mail,
• ze względu na automatyczne działanie platformy kontrahenci mają dostęp do faktur wystawionych w KSeF przez pomyłkę; spółka poinformował ich jednak o błędzie i poprosiła o zignorowanie tych dokumentów,
• według wiedzy spółki kontrahenci uwzględnili w swojej ewidencji zakupu JPK_VAT i odliczyli podatek naliczony na podstawie pierwotnych faktur wystawionych poza KSeF w lutym i marcu 2026 r., nie podjęli natomiast kroków w celu ponownego ujęcia lub rozliczenia tych dokumentów po ich omyłkowym wystawieniu w KSeF,
• spółka ujęła obrót i podatek należny z tytułu tych transakcji wyłącznie jeden raz, w plikach JPK_V7M za luty i marzec 2026 r., opierając się na fakturach wystawionych poza KSeF.

Zdaniem spółki w tej sytuacji:

• omyłkowe przesłanie w lipcu 2026 r. do systemu KSeF danych faktur historycznych z lutego i marca 2026 r. miało charakter wyłącznie błędu technicznego i nie nakłada na nią obowiązku wystawiania faktur korygujących; w przypadku pełnej zgodności obu dokumentów należy bowiem uznać, że nie powstały dwie niezależne faktury, lecz doszło do powtórzenia zapisu tej samej faktury w systemie,
• omyłkowe przesłanie tych dokumentów do KSeF nie rodzi obowiązku ponownej zapłaty podatku VAT na podstawie art. 108 ust. 1 ustawy o VAT ani nie wymaga dokonywania jakichkolwiek korekt w deklaracjach JPK_V7 za luty, marzec lub lipiec 2026 r.

Z firmly przygotujesz i wyślesz JPK_V7M lub JPK_V7K prosto z przeglądarki!
firmly ułatwia wprowadzanie faktur, generowanie JPK_V7M, JPK_V7K i JPK_FA, oraz umożliwia online wysyłkę do urzędu skarbowego z e-podpisem. Sprawdź statusy wysyłki i pobieraj Urzędowe Poświadczenia Odbioru (UPO) bezpośrednio w aplikacji.
Przejdź do firmly i ułatw sobie pracę z JPK »

Faktury wprowadzonej do KSeF nie można usunąć ani edytować

Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej zgodził się z tym stanowiskiem tylko częściowo. W interpretacji wskazał, że faktury przesłane do KSeF zostały błędnie wprowadzone do obrotu prawnego, gdyż dokumentują zdarzenia gospodarcze, które już były udokumentowane fakturami wysłanymi w sposób elektroniczny. Ponieważ system KSeF nie przewiduje możliwości anulowania, usunięcia czy edytowania wprowadzonej do niego faktury, jedynym sposobem wyeliminowania z KSeF takiego dokumentu jest wystawienie faktury korygującej “do zera”. Natomiast pozostawienie w KSeF faktur, które zostały tam przesłane omyłkowo, prowadziłoby do ryzyka zastosowania przez organ podatkowy art. 108 ust. 1 ustawy o VAT. Spółka ma więc obowiązek skorygowania faktur sprzedaży omyłkowo przesłanych do Krajowego Systemu e-Faktur (KSeF) w lipcu 2026 r. wraz ze wskazaniem numerów identyfikujących w Krajowym Systemie e-Faktur faktury, których ta korekta dotyczy (w elemencie DaneFaKorygowanej). Pozwoli to na zidentyfikowanie, że dokonywana korekta dotyczy faktur niezasadnie przesłanych do KSeF, a nie faktur wystawionych pierwotnie.

Odpowiadając na drugie pytanie Dyrektor KIS podkreślił, że spółka wykazała obrót i podatek należny z tytułu transakcji, których dotyczy wniosek, wyłącznie raz, w plikach JPK_V7M za luty i marzec 2026 r., w oparciu o faktury wystawione poza KSeF. Natomiast faktury wysłane omyłkowo do KSeF w lipcu 2026 r. nie zostały wykazane po raz drugi jako nowy obrót w pliku JPK_V7M za lipiec 2026 r. Wskazał też, że samo późniejsze pojawienie się numeru KSeF nie może powodować obowiązku korekty wcześniej złożonej deklaracji VAT wyłącznie w celu uzupełnienia identyfikatora dokumentu. Obowiązek wykazywania numeru KSeF faktury ustrukturyzowanej w ewidencji VAT powinien być bowiem oceniany według informacji dostępnych podatnikowi na moment składania przez niego deklaracji za dany okres rozliczeniowy. Omyłkowe przesłanie dokumentów do KSeF nie wymaga więc sporządzania ani składania korekt deklaracji JPK_V7 za luty, marzec ani lipiec 2026 r.

Od faktury skorygowanej do zera nie płaci się VAT

Źródło: indywidualna interpretacja 0113-KDIPT1-2.4012.826.2026.2.AB z 30 października 2026 r.